В понедельник, 23 июня 2008 г., по инициативе Высокопреосвященнейшего Исидора, митрополита Екатеринодарского и Кубанского, ректора Екатеринодарской Духовной Семинарии и в связи с началом реализации Кубанским госуниверситетом основной образовательной программы по направлению «Теология» (бакалавриат), состоялась встреча Владыки митрополита с исполняющим обязанности ректора Кубанского государственного университета Михаилом Борисовичем Астаповым.
В торжественной обстановке был подписан договор о сотрудничестве между Екатеринодарской Духовной Семинарией и Кубанским госуниверситетом, необходимый для установления и развития систематического научно-образовательного взаимодействия этих двух учебных заведений.

На встрече также присутствовали: от Кубанского государственного университета - заведующий отделением философии факультета истории, социологии и международных отношений КубГУ, доктор философских наук, профессор Бойко Павел Евгеньевич, осуществлявший значительную часть учебно-методической и организационной работы по подготовке открытия специальности Теология в КубГУ; представители учебно-методического управления университета. Екатеринодарская Духовная Семинария была представлена секретарем Ученого совета, кандидатом богословия, иереем Кириллом Коршуновым и преподавателем, кандидатом педагогических наук, протоиереем Алексием Касатиковым, отвечающим за подготовку преподавания специальных теологических дисциплин по вновь открываемой специальности.

В ходе общей беседы стороны обменялись мнениями по поводу перспектив теологического образования на Кубани и пришли к выводу о том, что интеграция научно-образовательного потенциала классического университета – одного из ведущих вузов России и духовного учебного заведения должна стать основой для плодотворного сотрудничества студентов и преподавателей КубГУ и ЕДС, что позволит готовить специалистов по православной теологии самой высокой квалификации.